Las instituciones afiliadas a la ANFEI están divididas en ocho regiones geográficamente distribuidas, las Regiones I y II corresponden a los estados del norte del país; las Regiones III y IV, a los estados del Bajío, y norte centro; la Región V son los estados que rodean a la Ciudad de México; las Regiones VI y VII son los estados del Sureste; y la Región VIII, la Ciudad de México y el Área Metropolitana del Valle de México.