Será un órgano que fungirá como autoridad para el gobierno de la Asociación.
Dado que los Miembros Activos de ANFEI son las instituciones, los cargos del Comité Ejecutivo no se otorgan a personas, sino a las Escuelas o Facultades que la integran.
Algunas de sus funciones son:
- Dar seguimiento al Programa de Trabajo del Comité.
- Formular los presupuestos anuales de ingresos y egresos.
- Vigilar la correcta aplicación del presupuesto de egresos.
- Rendir a la Asamblea General la cuenta anual de los gastos de la Asociación.
- Dar cumplimiento a las resoluciones y recomendaciones emanadas de la Asamblea General, del Comité Ejecutivo, de la Conferencia Nacional de Ingeniería y de la Reunión General de Directores.
- Convocar a la Asamblea General.
- En general, realizar todos los actos que tiendan a lograr los fines de la Asociación.